RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEPDC1Q5TB30 811 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRLBQ6BAA4 426 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCA5Q86VQ0 697 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF595Q8IYB9 648 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4X1Q8N118 509 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAS2Q92819 552 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 REPS1Q96D71 796 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPAS2Q99743 824 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTMT1Q9BV86 223 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYRM4Q9HD34 91 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASF1BQ9NVP2 202 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCMF1Q9P0J7 381 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP10Q9P2G4 905 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYTNA2CJ06 578 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MUI8 341 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS4BO75351 444 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYGBP11216 843 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF10P50591 281 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNG1P51959 295 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHEXP78562 749 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC13A2Q13183 592 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF2BQ8N4N8 673 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELP5Q8TE02 316 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC77Q9BR77 488 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEKT2Q9UIF3 430 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS4AQ9UN37 437 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN13Q12923 2485 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTL3 188 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MUA0 341 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN4O14493 209 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPP1O14494 284 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAN1A2O60476 641 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETHE1O95571 254 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNLYP22749 145 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2R1BP30154 601 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK2P51955 445 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP1GDS1P52306 607 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSNL1P62760 191 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCN2Q14257 317 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACER2Q5QJU3 275 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C11Q6IEV9 310 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLNKQ7Z7G1 428 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEST3Q8N1M1 668 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGMAQ96B86 450 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF354BQ96LW1 612 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESPL1Q14674 2120 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPM1 405 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5H15A6NDH6 313 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP6CO00743 305 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO1A2P46721 670 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH13P55290 713 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERVK_113P63132 956 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUL3Q13618 768 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TERF2Q15554 542 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDRPQ86YL5 185 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNPY4Q8N129 248 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM237Q96Q45 408 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPKQ9BS16 269 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 STMN3Q9NZ72 180 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPT2Q9UMR5 302 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLX3O60479 287 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNSO60931 367 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1DO94832 1006 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTA1P08263 222 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN8P19075 237 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAC1P20366 129 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms