RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308344.9

CLDN15-201, Transcript of claudin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN15, Length 1,370 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15-201ENST00000308344 SLC5A8Q8N695 610 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 HUS1BQ8NHY5 278 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FAR1Q8WVX9 515 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 REPS1Q96D71 796 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PHF21BQ96EK2 531 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 NPAS2Q99743 824 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 LYRM4Q9HD34 91 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FETUBQ9UGM5 382 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SMIM24O75264 130 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 MYBL2P10244 700 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SLC13A2Q13183 592 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TERF2Q15554 542 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 INAQ16352 499 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CNPY4Q8N129 248 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 BEST3Q8N1M1 668 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ACOT4Q8N9L9 421 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FAM47BQ8NA70 645 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 OR51B5Q9H339 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ABI3Q9P2A4 366 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SVILO95425 2214 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 A8MUA0 341 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CDK2AP1O14519 115 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CTNSO60931 367 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ARFIP1P53367 373 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FHL5Q5TD97 284 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FAM180AQ6UWF9 173 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 RGMAQ96B86 450 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CSF3RQ99062 836 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 POLEQ07864 2286 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 OR7A17O14581 309 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PRAMEF2O60811 474 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SH3BGRLO75368 114 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CLDN9O95484 217 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SSR2P43308 183 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PHEXP78562 749 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 OR4C11Q6IEV9 310 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 LCA5Q86VQ0 697 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 RNF175Q8N4F7 328 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CENPKQ9BS16 269 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 NTMT1Q9BV86 223 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PCTPQ9UKL6 214 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SPACA6W5XKT8 324 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 BLACEA4D250 179 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 MYO1DO94832 1006 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 SBK3P0C264 359 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TUBA3CQ13748 450 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 TUBA3EQ6PEY2 450 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 BCORP1Q8N888 145 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 APCDD1LQ8NCL9 501 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PRR7Q8TB68 274 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 CDCP1Q9H5V8 836 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 ZGRF1Q86YA3 2104 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN15-201ENST00000308344 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 MAN1A2O60476 641 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 CD96P40200 585 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 CCNG1P51959 295 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 RAP1GDS1P52306 607 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN15-201ENST00000308344 CUL3Q13618 768 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms