RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297661.8

UBAP1-201, Transcript of ubiquitin associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBAP1, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1-201ENST00000297661 FBXL6Q8N531 539 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ASB11Q8WXH4 323 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ASB15Q8WXK1 588 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 COQ8BQ96D53 544 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SCRN2Q96FV2 425 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 COL21A1Q96P44 957 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 A0A1W2PRU2 124 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SOCS5O75159 536 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SCO1O75880 301 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 KCNK5O95279 499 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SOD2P04179 222 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 OR56A5P0C7T3 313 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TNFRSF1BP20333 461 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 GZMKP49863 264 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TOR2AQ5JU69 321 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 STX19Q8N4C7 294 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 GPR156Q8NFN8 814 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TMEM169Q96HH4 297 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 FRMD6Q96NE9 622 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 KCNC2Q96PR1 638 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.93□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 B4DXG7 233 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 RFXAPO00287 272 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CSF2P04141 144 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PSKH1P11801 424 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 OLR1P78380 273 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 IRF8Q02556 426 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SCN1BQ07699 218 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 BTBD16Q32M84 506 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 XKR6Q5GH73 641 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 USP45Q70EL2 814 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 NLRP8Q86W28 1048 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 NELL1Q92832 810 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CCDC120Q96HB5 630 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 MTG2Q9H4K7 406 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 BRD9Q9H8M2 597 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CCL26Q9Y258 94 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 E7EQ34 232 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CCNDBP1O95273 360 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ETHE1O95571 254 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 FABP3P05413 133 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PRPS2P11908 318 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PTGS2P35354 604 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SLC6A12P48065 614 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PREPP48147 710 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PFN3P60673 137 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 PTOV1Q86YD1 416 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 LAX1Q8IWV1 398 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 RDH10Q8IZV5 341 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 RAD9AQ99638 391 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SRRQ9GZT4 340 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 RAD18Q9NS91 495 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 AGAP14A8MT82 685 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TSPAN9O75954 239 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 GBAP04062 536 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ALPPP05187 535 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 WNT3P56703 355 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ST3GAL4Q11206 333 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 VMACQ2NL98 169 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 FAHD1Q6P587 224 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.91□□□□□ -0.02
UBAP1-201ENST00000297661 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms