RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTW7 788 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRA5A6NI73 299 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SCELO95171 688 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 EPN2O95208 641 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSBP07858 339 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 VHLP40337 213 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTM5P46439 218 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH9A1P49189 494 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9A5Q14940 896 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ADRM1Q16186 407 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PROSER1Q86XN7 944 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SHISA5Q8N114 240 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST8Q9H2A9 424 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC28Q96AY4 2481 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJB6O75190 326 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK5O95279 499 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX2P28328 305 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KA3P51812 740 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 BTN3A2P78410 334 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD18Q0P651 414 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINA11Q86U17 422 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 AVL9Q8NBF6 648 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC38A3Q99624 504 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 IL21RQ9HBE5 538 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RP1P56715 2156 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRB8 838 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS12A0PJE2 317 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GLOD5A6NK44 160 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PGRMC2O15173 223 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS1Q08116 209 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C18orf63Q68DL7 685 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PTOV1Q86YD1 416 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MICU2Q8IYU8 434 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP11Q96EK4 314 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF570Q96NI8 536 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM15Q9C019 465 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS4AQ9UN37 437 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 STAMBPO95630 424 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PROS1P07225 676 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RXRGP48443 463 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TEAD4Q15561 434 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP51A1Q16850 503 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FIG4Q92562 907 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TSC22D3Q99576 134 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP3K3Q99759 626 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC42Q9Y546 428 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM221A6NGB7 291 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms