RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281043.3

MYCN-201, Transcript of MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MYCN, Length 2,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCN-201ENST00000281043 HSDL2Q6YN16 418 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 NAGSQ8N159 534 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 UPRTQ96BW1 309 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 AP2M1Q96CW1 435 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 QRFPRQ96P65 431 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FAM129BQ96TA1 746 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.52■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PCDH17O14917 1159 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PRMT3O60678 531 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ACPPP15309 386 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ARSBP15848 533 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 EVI2BP34910 448 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CNR2P34972 360 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CDH4P55283 916 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PER3P56645 1201 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ANGPT1Q15389 498 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TEAD4Q15561 434 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 J3KTA2 159 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PCDH7O60245 1069 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TPST2O60704 377 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TM4SF4P48230 202 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CLDN20P56880 219 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 RAB25P57735 213 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FRG2Q64ET8 278 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 OR8H3Q8N146 312 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FRG2BQ96QU4 278 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 DUSP26Q9BV47 211 aa20.51■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ALPK3Q96L96 1907 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 A8MVJ9 347 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 H3BNC9 293 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 HLA-DQB1P01920 261 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 RHOCP08134 193 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MSL3P1P0C860 447 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PRKAR1AP10644 381 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 POU1F1P28069 291 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 NFATC2Q13469 925 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FAM122CQ6P4D5 195 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 LINGO4Q6UY18 593 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 UROC1Q96N76 676 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ORC5O43913 435 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 RFPL3O75679 317 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FAM157BP0CG42 384 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ZNF250P15622 560 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 RGS1Q08116 209 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MBTPS1Q14703 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TEX261Q6UWH6 196 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 MND1Q9BWT6 205 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 U3KQ87 197 aa20.5■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 C1orf226A1L170 272 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ZAR1LA6NP61 321 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ACSL4O60488 711 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ENTPD6O75354 484 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 SLC43A1O75387 559 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 DGKEP52429 567 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 Q8N402 240 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.49■□□□□ 0.87
MYCN-201ENST00000281043 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms