RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 PTPN2P17706 415 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 PRMT2P55345 433 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC13A2Q13183 592 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 BCL7AQ4VC05 210 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 GASTP01350 101 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 EPHA5P54756 1037 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 ARHGEF6Q15052 776 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 USP43Q70EL4 1123 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 PSD2Q9BQI7 771 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 CCNB2O95067 398 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 C12orf40Q86WS4 652 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 GIN1Q9NXP7 522 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 ANGPT4Q9Y264 503 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 ALPK3Q96L96 1907 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3GL1-201ENST00000269886 HMGA2P52926 109 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 AGAP5A6NIR3 686 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 UPK1BO75841 260 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 KRT75O95678 551 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 DSTNP60981 165 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ITPKCQ96DU7 683 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ABCG4Q9H172 646 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.95■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LYSMD2Q8IV50 215 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NUS1Q96E22 293 aa22.95■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM221A6NGB7 291 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 A8MVJ9 347 aa22.94■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 MMP20O60882 483 aa22.94■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 CISD3P0C7P0 127 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CHMP24386 653 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SEPHS1P49903 392 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LIM2P55344 173 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 IRF3Q14653 427 aa22.94■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 HPS1Q92902 700 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MTERF3Q96E29 417 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 Q96MT0 163 aa22.94■■□□□ 1.26
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SH3GL1-201ENST00000269886 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NOTCH4Q99466 2003 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 IFNW1P05000 195 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 RHCEP18577 417 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ACADLP28330 430 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.93■■□□□ 1.26
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