RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
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CTCF-201ENST00000264010 CD300CQ08708 224 aa15.61■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 SYT16Q17RD7 645 aa15.61■□□□□ 0.09
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CTCF-201ENST00000264010 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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CTCF-201ENST00000264010 NUDT13Q86X67 352 aa15.6■□□□□ 0.09
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CTCF-201ENST00000264010 IL3P08700 152 aa15.59■□□□□ 0.09
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CTCF-201ENST00000264010 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.59■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CTCF-201ENST00000264010 TSPAN11A1L157 253 aa15.59■□□□□ 0.09
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