RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 PLIN5Q00G26 463 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PRSS53Q2L4Q9 553 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DLEU7Q6UYE1 221 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 C10orf90Q96M02 699 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 RMND5AQ9H871 391 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa21.49■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PR48 441 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FITM1A5D6W6 292 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 B3GALT2O43825 422 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 TBX19O60806 448 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 GUCY1B2O75343 617 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MED26O95402 600 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DRD2P14416 443 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 TGM1P22735 817 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ALDH9A1P49189 494 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 RUNX2Q13950 521 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ANKRD46Q86W74 232 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 UCN3Q969E3 161 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 SPTBP11277 2137 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 HYKKA2RU49 373 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PROM1O43490 865 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CBFA2T3O75081 653 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DNAJB6O75190 326 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 KCNH1O95259 989 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 NDUFA9Q16795 377 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MPEG1Q2M385 716 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ITCHQ96J02 903 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.48■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 C4orf47A7E2U8 309 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 D6RAR5 112 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FOXM1Q08050 763 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MUM1Q2TAK8 710 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 C18orf63Q68DL7 685 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 MIEF2Q96C03 454 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CDRT15Q96T59 188 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 INPP5KQ9BT40 448 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DAPP1Q9UN19 280 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa21.47■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 OR2B3O76000 313 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 AIFM1O95831 613 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 EMP3P54852 163 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 LIM2P55344 173 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 OLR1P78380 273 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FAM53BQ14153 422 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 GRM7Q14831 915 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FAM47BQ8NA70 645 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 OR1L3Q8NH93 324 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 EHD3Q9NZN3 535 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 PHF11Q9UIL8 331 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.46■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 C1orf226A1L170 272 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 FOXS1O43638 330 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 SPIDRQ14159 915 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.45■■□□□ 1.03
UFD1-201ENST00000263202 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms