RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 ASB15Q8WXK1 588 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FRMD6Q96NE9 622 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 NRTNQ99748 197 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MTG2Q9H4K7 406 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SNX7Q9UNH6 387 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CD22P20273 847 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GPC1P35052 558 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TCEA2Q15560 299 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF385BQ569K4 471 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TMED9Q9BVK6 235 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TLR4O00206 839 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CASKO14936 926 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 YES1P07947 543 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SPAM1P38567 509 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OLR1P78380 273 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CA12O43570 354 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CRYZL1O95825 349 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BCHEP06276 602 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CD72P21854 359 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SELENOWP63302 87 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CDK6Q00534 326 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HSPB3Q12988 150 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GPAT3Q53EU6 434 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 A8MUA0 341 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 F11P03951 625 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SP3Q02447 781 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ADGRF1Q5T601 910 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FAHD1Q6P587 224 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KRT74Q7RTS7 529 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC190Q86UF4 302 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KLK1P06870 262 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ANXA8P13928 327 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GPX2P18283 190 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF79Q15937 498 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TATDN3Q17R31 274 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MICAQ29983 383 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KAT2AQ92830 837 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MCUBQ9NWR8 336 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 LHX3Q9UBR4 397 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF222Q9UK12 451 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OR6C75A6NL08 312 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 EOMESO95936 686 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OR56A5P0C7T3 313 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 AVPR1BP47901 424 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CAP1Q01518 475 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MAP4K2Q12851 820 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ERICH5Q6P6B1 374 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CACUL1Q86Y37 369 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC7A6Q92536 515 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TBX5Q99593 518 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HHATLQ9HCP6 504 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 NTN1O95631 604 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms