RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tex19.1Q99MV2 351 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nacc2Q9DCM7 586 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 KelQ9EQF2 713 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P2ry4Q9JJS7 361 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trpc4apQ9JLV2 797 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa18.6■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm8444F6XS56 118 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnk16G5E845 292 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nipsnap2O55126 281 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scd1P13516 355 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Impdh1P50096 514 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hcrtr1P58307 416 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nup43P59235 380 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nkx3-2P97503 333 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stx2Q00262 289 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp8b1Q148W0 1251 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FcrlbQ5DRQ8 427 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Galnt2Q6PB93 570 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GalpQ810H5 117 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc25a40Q8BGP6 337 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CntrobQ8CB62 887 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rln3Q8CHK2 141 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1310Q8VF85 312 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1411Q8VFC4 323 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc5a2Q923I7 670 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Foxp3Q99JB6 429 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dhrs7Q9CXR1 338 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rcan2Q9JHG2 197 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1508Q9R0K4 310 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Skp1Q9WTX5 163 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cldn9Q9Z0S7 217 aa18.59■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam131cA2ADB2 273 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ighg2cF6TQW2 404 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aff2O55112 1272 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P01864 335 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hoxd9P28357 339 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EpxP49290 716 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Inpp1P49442 396 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lemd1Q14C37 129 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q3U4G0 281 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpr39Q5U431 456 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc6a3Q61327 619 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zic2Q62520 530 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atg4dQ8BGV9 474 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8BP99 230 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acp7Q8BX37 438 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxw17Q8CFE8 466 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sidt2Q8CIF6 832 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kdelr3Q8R1L4 214 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn1r217Q8R270 298 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pex19Q8VCI5 299 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DnlzQ9D113 177 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IqchQ9D2K4 1071 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacna1cQ01815 2139 aa18.58■□□□□ 0.57
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MpdzQ8VBX6 2055 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm13088A2AGW6 460 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prrt4B2RU40 902 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smok3aC0HKC8 504 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smok3bC0HKC9 504 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn1r175K7N6T9 304 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Reps1O54916 795 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sap18O55128 153 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PcnaP17918 261 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bmp8bP55105 399 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps13P62301 151 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 S100a13P97352 98 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnab3P97382 249 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spata6Q3U6K5 488 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam92aQ8BP22 355 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam53cQ8BXQ8 393 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sertm1Q8CD78 107 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc16a14Q8K1C7 512 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr1278Q8VF39 313 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc34Q9DAM1 415 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nectin1Q9JKF6 515 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sptbn2Q68FG2 2388 aa18.58■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RelnQ60841 3461 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sec16aA2AIX1 2377 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc43a3A2AVZ9 502 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam84bD3YXJ5 310 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl4a1O35256 227 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ncf2O70145 525 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P04213 122 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Msx1P13297 303 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cox5bP19536 128 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prim2P33610 505 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ripk2P58801 539 aa18.57■□□□□ 0.56
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uhmk1P97343 419 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.8 ms