RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC182A6NF36 153 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ARHGAP33O14559 1287 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 YY2O15391 372 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TPST2O60704 377 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GPX5O75715 221 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C9P02748 559 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CDK1P06493 297 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ADRA2AP08913 450 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SDHBP21912 280 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAPK8P45983 427 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCR4P51679 360 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 KRT74Q7RTS7 529 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LGI4Q8N135 537 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SNAPC3Q92966 411 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 BRD9Q9H8M2 597 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DKK3Q9UBP4 350 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PSME4Q14997 1843 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1B0GVM2 712 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCDH17O14917 1159 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ICMTO60725 284 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ARL4DP49703 201 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FADDQ13158 208 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 CDK20Q8IZL9 346 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 PSKH2Q96QS6 385 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR2A14Q96R47 310 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RAD9AQ99638 391 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 SCO1O75880 301 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 GJB5O95377 273 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CBLP22681 906 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GZMMP51124 257 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ITGA1P56199 1179 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 GNG2P59768 71 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PRKCDQ05655 676 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HKDC1Q2TB90 917 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MPPE1Q53F39 396 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL12Q53G59 568 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CPTPQ5TA50 214 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 FOXJ1Q92949 421 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 COL21A1Q96P44 957 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PKP4Q99569 1192 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ASF1AQ9Y294 204 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1W2PQ72 361 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1W2PRU2 124 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 WASH4PA8MWX3 477 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CDRT1O95170 752 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NR2F6P10588 404 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PSKH1P11801 424 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ETFAP13804 333 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAGEA11P43364 429 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RFX2P48378 723 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 QPRTQ15274 297 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GPAT3Q53EU6 434 aa6.68□□□□□ -1.34
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