RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 OR4D2P58180 307 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 KRT33BQ14525 404 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 HM13Q8TCT9 377 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TESCQ96BS2 214 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PYCR2Q96C36 320 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 C12orf66Q96MD2 445 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SLC29A1Q99808 456 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CIB1Q99828 191 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 UCK1Q9HA47 277 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 THSD1Q9NS62 852 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 UBXN7O94888 489 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TNFAIP8O95379 198 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TYRP1P17643 537 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CFHR1Q03591 330 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CHIT1Q13231 466 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PHC3Q8NDX5 983 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF583Q96ND8 569 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 GBP5Q96PP8 586 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 VAPAQ9P0L0 249 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.56■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 LILRA5A6NI73 299 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 A8MU76 341 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 GGT1P19440 569 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 E2F2Q14209 437 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SELPLGQ14242 412 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 MAP7Q14244 749 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 GPR18Q14330 331 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 NRF1Q16656 503 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RNF220Q5VTB9 566 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 GLYATQ6IB77 296 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 OR56A3Q8NH54 315 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PISDQ9UG56 409 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL3Q9UH77 587 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.55■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PRMT3O60678 531 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CDH1P12830 882 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 HSD3B1P14060 373 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 NCK1P16333 377 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 HSD3B2P26439 372 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CSF2RBP32927 897 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 30.5
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SGMS1-210ENST00000619438 MTPNP58546 118 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 IRF8Q02556 426 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 ABRQ12979 859 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PLCL1Q15111 1095 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6AP1Q15904 470 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CARM1Q86X55 608 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 FAM110BQ8TC76 370 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 NUDT8Q8WV74 236 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CNBD2Q96M20 576 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 FOPNLQ96NB1 174 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 OR52E6Q96RD3 313 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 CENPKQ9BS16 269 aa20.54■□□□□ 0.88
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