RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 LPAR4Q99677 370 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 NTMT1Q9BV86 223 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 TBK1Q9UHD2 729 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.39■■□□□ 1.34
PMS1-220ENST00000618056 A8MT66 165 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 FAM227AF5H4B4 570 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 OR7A17O14581 309 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 GSTA1P08263 222 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CERS1P27544 350 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MLLT10P55197 1068 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 BTG2P78543 158 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 FOXK1P85037 733 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 RASA2Q15283 850 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 EXT1Q16394 746 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB26Q9HCK0 441 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SLAMF7Q9NQ25 335 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 DAPP1Q9UN19 280 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TTLL8A6PVC2 850 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SCELO95171 688 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CLDN9O95484 217 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ITGAMP11215 1152 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 OR4D2P58180 307 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 VSNL1P62760 191 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 OR52B6Q8NGF0 335 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 DMRT3Q9NQL9 472 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PTGFRNQ9P2B2 879 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TGFB1P01137 390 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PYGBP11216 843 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TSFMP43897 325 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CCNG1P51959 295 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ARFIP1P53367 373 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 LIM2P55344 173 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B7P56937 341 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PHEXP78562 749 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TRAF3Q13114 568 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 RCN2Q14257 317 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 BTBD16Q32M84 506 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ZNF793Q6ZN11 406 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SIRT6Q8N6T7 355 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 WDR20Q8TBZ3 569 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 M1APQ8TC57 530 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ATP6V1E2Q96A05 226 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MIB2Q96AX9 1013 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 LYRM4Q9HD34 91 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PPT2Q9UMR5 302 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8RI6L899 631 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CYR61O00622 381 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 TAC1P20366 129 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MAOAP21397 527 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B3P37058 310 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 LINC00696Q6ZRV3 163 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 AMER2Q8N7J2 671 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 OR51B5Q9H339 312 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 MMP25Q9NPA2 562 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 NECTIN3Q9NQS3 549 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ESPL1Q14674 2120 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SVILO95425 2214 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CLDN4O14493 209 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 H3F3CQ6NXT2 135 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 WDR93Q6P2C0 686 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CPT1CQ8TCG5 803 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 RGMAQ96B86 450 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CDK15Q96Q40 435 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-220ENST00000618056 CENPKQ9BS16 269 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms