RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MSLNLQ96KJ4 702 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB26Q9HCK0 441 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FKBPLQ9UIM3 349 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf27AQ580R0 203 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TSTD2Q5T7W7 516 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GID4Q8IVV7 300 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 BTBD1Q9H0C5 482 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GMEB2Q9UKD1 530 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 IRF6O14896 467 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ATG12O94817 140 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ESR1P03372 595 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4Q2P0C623 313 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SHMT1P34896 483 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 THBS2P35442 1172 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R39P59534 338 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO22Q8NEZ5 403 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PLD4Q96BZ4 506 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 AKTIPQ9H8T0 292 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CD8B2A6NJW9 211 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CD8BP10966 210 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MFSD5Q6N075 450 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ACP5P13686 325 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RSU1Q15404 277 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ELP2Q6IA86 826 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SPPL2BQ8TCT7 592 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A14Q9Y267 594 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A2O15244 555 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TSSK6Q9BXA6 273 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB3BP20337 219 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HTR7P34969 479 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HNF1BP35680 557 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DGKGP49619 791 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SERINC3Q13530 473 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM15Q7Z3B0 74 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 COMMD7Q86VX2 200 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF442Q9H7R0 627 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CDKN2BP42772 138 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 KDELC1Q6UW63 502 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HAS2Q92819 552 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RCCD1A6NED2 376 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GOSR2O14653 212 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DNASE1P24855 282 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PBX3P40426 434 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PPA1Q15181 289 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 LRFN4Q6PJG9 635 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GLYATL1Q969I3 302 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 B3GNT2Q9NY97 397 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R9Q9NYW1 312 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 WNT10BO00744 389 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKCGP05129 697 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C8orf89P0DMQ9 161 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CAPSQ13938 189 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALT5O43286 388 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKACAP17612 351 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MOGSQ13724 837 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NATD1Q8N6N6 113 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RBP7Q96R05 134 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C17orf62Q9BQA9 187 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEH1Q9H213 219 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 THAP4Q8WY91 577 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ASB9Q96DX5 294 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC12Q96GR4 267 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 EPHA1P21709 976 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGCS1Q01581 520 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MROQ9BYG7 248 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM227AF5H4B4 570 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 H0Y8G0 127 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 WNT9AO14904 365 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD28O15084 1053 aa17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms