RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	ABCG4	Q9H172	646 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGAP33	O14559	1287 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SOD1	P00441	154 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SERPIND1	P05546	499 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00271	P0C7V0	271 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ADH5	P11766	374 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DMC1	Q14565	340 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	LGI4	Q8N135	537 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ARRDC3	Q96B67	414 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	COQ8B	Q96D53	544 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCM1	Q15154	2024 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HSD3B1	P14060	373 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HSD3B2	P26439	372 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC19A1	P41440	591 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCYT1A	P49585	367 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MVD	P53602	400 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TUBA1B	P68363	451 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM16L	Q309B1	348 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TUBA1A	Q71U36	451 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GPR83	Q9NYM4	423 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1W2PRB8	838 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCDH17	O14917	1159 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GABARAP	O95166	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CDH3	P22223	829 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PTGER1	P34995	402 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCGF2	P35227	344 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CDK6	Q00534	326 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CNTN1	Q12860	1018 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF566	Q969W8	418 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	FEZF1	A0PJY2	475 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	SCAMP1	O15126	338 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	SPINT1	O43278	529 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	FURIN	P09958	794 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	JUND	P17535	347 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	PSMB5	P28074	263 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	FAHD1	Q6P587	224 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	RAB8B	Q92930	207 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	REPS1	Q96D71	796 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	TAC3	Q9UHF0	121 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	LIPA	P38571	399 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	WAS	P42768	502 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	DNASE1L3	Q13609	305 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	TCEA2	Q15560	299 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	TEAD4	Q15561	434 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SMTN-222	ENST00000612341	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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