RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM40Q6P9F5 258 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 GALNT10Q86SR1 603 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 NRROSQ86YC3 692 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MAL2Q969L2 176 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM4Q9C037 500 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 AICDAQ9GZX7 198 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PDPK1O15530 556 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 KRT75O95678 551 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ETFAP13804 333 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CAPGP40121 348 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 RNF220Q5VTB9 566 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF425Q6IV72 752 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ABCG4Q9H172 646 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 IL1RAPQ9NPH3 570 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 DMTF1Q9Y222 760 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 A0A0G2JN53 185 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MAP3K13O43283 966 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TNFRSF21O75509 655 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SNAP29O95721 258 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SEMG1P04279 462 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ALPLP05186 524 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 GNAO1P09471 354 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 UQCRC2P22695 453 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 IST1P53990 364 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 HYAL2Q12891 473 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MS4A6EQ96DS6 147 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 HSH2DQ96JZ2 352 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 NLNQ9BYT8 704 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 KLHL31Q9H511 634 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 BTN3A3O00478 584 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 STATHP02808 62 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ARFIP1P53367 373 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CASP9P55211 416 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 RBBP4Q09028 425 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PLCL1Q15111 1095 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SLC5A12Q1EHB4 618 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 RNF130Q86XS8 419 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 AMER3Q8N944 861 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 OR5K1Q8NHB7 308 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 KCNC2Q96PR1 638 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 GPR174Q9BXC1 333 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 KLHL20Q9Y2M5 609 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PPM1DO15297 605 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 E2F6O75461 281 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 FKBP9O95302 570 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ALBP02768 609 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 FABP3P05413 133 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PRIM2P49643 509 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 KIR2DS3Q14952 304 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF793Q6ZN11 406 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CXorf36Q9H7Y0 433 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 NEUROD4Q9HD90 331 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 C1GALT1Q9NS00 363 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CA14Q9ULX7 337 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SNX8Q9Y5X2 465 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 H0YAE9 185 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 H6PDO95479 791 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 DRD2P14416 443 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 CD6P30203 668 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 FRKP42685 505 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-221ENST00000597512 SLC9A5Q14940 896 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms