RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	HPCAL1	P37235	193 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC19A1	P41440	591 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	REEP5	Q00765	189 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MTAP	Q13126	283 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP6AP1	Q15904	470 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GJD3	Q8N144	294 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX19	Q92543	992 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GTF2H4	Q92759	462 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	UBE2E3	Q969T4	207 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TESC	Q96BS2	214 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TXNDC15	Q96J42	360 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RHBG	Q9H310	441 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SP140L	Q9H930	580 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	METTL12	A8MUP2	240 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318		H7BY64	318 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	JRK	O75564	520 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TGFB1	P01137	390 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TNF	P01375	233 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PCSK2	P16519	638 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FAS	P25445	335 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CCR8	P51685	355 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPIN4	Q56A73	249 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RABL3	Q5HYI8	236 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT78	Q8N1N4	520 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CBR4	Q8N4T8	237 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR156	Q8NFN8	814 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	OR51B5	Q9H339	312 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	INVS	Q9Y283	1065 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		14.71	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DLGAP1	O14490	977 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LRAT	O95237	230 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NDUFS1	P28331	727 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C21orf58	P58505	322 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CSNK1G2	P78368	415 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SYT12	Q8IV01	421 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LACC1	Q8IV20	430 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB119	Q8N690	84 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MUC13	Q9H3R2	512 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NT5DC2	Q9H857	520 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FEZF1	A0PJY2	475 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ISPD	A4D126	451 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL18	O94889	574 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	B3GALT4	O96024	378 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	WNT1	P04628	370 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HSD17B1	P14061	328 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CKMT2	P17540	419 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PRPS1L1	P21108	318 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CD27	P26842	260 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SERPINB10	P48595	397 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	BNIP2	Q12982	314 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SELENBP1	Q13228	472 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PWP1	Q13610	501 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	UGT8	Q16880	541 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	USP51	Q70EK9	711 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXL6	Q8N531	539 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SERHL	Q9NQF3	203 aa		14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		14.69	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PR77	199 aa		14.69	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM172BP	A6NC97	362 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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