RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GP1BAP07359 652 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FURINP09958 794 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD34CP0C6C1 535 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CERS1P27544 350 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLC1Q07866 573 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE7AQ13946 482 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNAB1Q14722 419 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEFB134Q4QY38 66 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCTE1Q5JU00 501 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 C16orf89Q6UX73 402 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR180Q86V85 440 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 COQ8BQ96D53 544 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTERF3Q96E29 417 aa22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A088AWK7 358 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSL3P1P0C860 447 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNJ2P63252 427 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAPKAPK3Q16644 382 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPTPQ5TA50 214 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DPP10Q8N608 796 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERINC2Q96SA4 455 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB4Q9Y574 426 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.19■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAMP1P11279 417 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDCP20711 480 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR41Q9HAD4 459 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.18■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CFAP73A6NFT4 308 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GUCY1B2O75343 617 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPPAP01160 153 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAXDQ8IW45 347 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPCDCQ96CD2 204 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DUSP26Q9BV47 211 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GID8Q9NWU2 228 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPEGQ15772 3267 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOLR1P15328 257 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 WNT3P56703 355 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NFYCQ13952 458 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMP21Q8N119 569 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GTF2H4Q92759 462 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC58Q96CX6 371 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 RMND5AQ9H871 391 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.17■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FITM1A5D6W6 292 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 H3BMH7 237 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 B3GALT2O43825 422 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCN2BO60939 215 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 DRD2P14416 443 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL1RNP18510 177 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TGM1P22735 817 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFA9Q16795 377 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDSS2Q86YH6 399 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 THTPAQ9BU02 230 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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