RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GPHN-215	ENST00000557654	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GPHN-215	ENST00000557654	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GPHN-215	ENST00000557654	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GPHN-215	ENST00000557654	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EPCAM	P16422	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CPT2	P23786	658 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HLA-F	P30511	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CAPZA2	P47755	286 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CLDN15	P56746	228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLC8A3	P57103	927 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MYL7	Q01449	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LY6D	Q14210	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76	1e-6	■■■■□ 22.7
GPHN-215	ENST00000557654	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KRT39	Q6A163	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PROX1	Q92786	737 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CPD	O75976	1380 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MET	P08581	1390 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ACE	P12821	1306 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		E7EWF7	191 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		H0YAE9	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		O00370	1275 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RTN2	O75298	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM50B	P56557	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RBPJ	Q06330	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PAX8	Q06710	450 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SPAG1	Q07617	926 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PNOC	Q13519	176 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AMER3	Q8N944	861 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	URAD	A6NGE7	173 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CLDN4	O14493	209 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SNX3	O60493	162 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IL11	P20809	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NF2	P35240	595 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	OR3A2	P47893	321 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CSRP3	P50461	194 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PPP5C	P53041	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GNGT1	P63211	74 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM29	Q14134	588 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TAB1	Q15750	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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