RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PPTC7Q8NI37 304 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 AGR3Q8TD06 166 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GIPC3Q8TF64 312 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KAT2AQ92830 837 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 HDAC11Q96DB2 347 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MAGED4Q96JG8 741 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF560Q96MR9 790 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 LGMNQ99538 433 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 NPAS2Q99743 824 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 OLFM1Q99784 485 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 C1orf50Q9BV19 199 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KIFC1Q9BW19 673 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 POMKQ9H5K3 350 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 THSD1Q9NS62 852 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 POT1Q9NUX5 634 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GID8Q9NWU2 228 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GIN1Q9NXP7 522 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM181Q9P2C4 612 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KCND3Q9UK17 655 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GJD2Q9UKL4 321 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PLXNB2O15031 1838 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 EVPLQ92817 2033 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 SZT2Q5T011 3432 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TRIM64BA6NI03 449 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 H0YAE9 185 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 J3KRW8 73 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PDHXO00330 501 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CLOCKO15516 846 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ATG13O75143 517 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ANXA9O76027 345 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 OAZ2O95190 189 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 F9P00740 461 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CD4P01730 458 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TK1P04183 234 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 WNT1P04628 370 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MMP3P08254 477 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 OCM2P0CE71 109 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CHRNB1P11230 501 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PSG1P11464 419 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CAPGP40121 348 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CD151P48509 253 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ENTPD1P49961 510 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 HLCSP50747 726 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CLCN5P51795 746 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GEMP55040 296 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TPI1P60174 286 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 MERTKQ12866 999 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 EPS8Q12929 822 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 EFR3AQ14156 821 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GK3PQ14409 553 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GALNT3Q14435 633 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 GRB14Q14449 540 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TOMM20Q15388 145 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 DLG2Q15700 870 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 ATP6AP1Q15904 470 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TAF12Q16514 161 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 SLC36A3Q495N2 470 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM198Q66K66 360 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 LCN8Q6JVE9 175 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATXN3-246ENST00000557030 C16orf87Q6PH81 154 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms