RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 LUZP2Q86TE4 346 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 KATNAL2Q8IYT4 538 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RCOR2Q8IZ40 523 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FAM136AQ96C01 138 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SGCZQ96LD1 299 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 REG4Q9BYZ8 158 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 USF3Q68DE3 2245 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CTAGE15A4D2H0 777 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZNF839A8K0R7 811 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SPOPO43791 374 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SOX18P35713 384 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MC3RP41968 323 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 GRIA1P42261 906 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZNF321PQ8N8H1 164 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 KRT35Q92764 455 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 NTNG2Q96CW9 530 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SLC30A3Q99726 388 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CCDC77Q9BR77 488 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 A8MXE2 369 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 C4orf51C9J302 202 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CATP04040 527 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 P04436 131 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SMIM10L1P0DMW3 83 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CRYGSP22914 178 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SLCO1A2P46721 670 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TTPAP49638 278 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TCEAL1Q15170 157 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 STX1AQ16623 288 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 HECTD2Q5U5R9 776 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 LYPD8Q6UX82 237 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 LRRC6Q86X45 466 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CA13Q8N1Q1 262 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TMEM52Q8NDY8 209 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 LRRC45Q96CN5 670 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SMIM10Q96HG1 83 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TRIB1Q96RU8 372 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 FAM129AQ9BZQ8 928 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 AICDAQ9GZX7 198 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 GFYI3L273 518 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 PJA2O43164 708 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 NDUFS4O43181 175 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CEP104O60308 925 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 GYPCP04921 128 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 RNH1P13489 461 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 ADRA1DP25100 572 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 FMO4P31512 558 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 GDF10P55107 478 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 ATP5J2P56134 94 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 TBPL1P62380 186 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 PRAMEP78395 509 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 FAM27E3Q08E93 113 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-208ENST00000547298 CDH17Q12864 832 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms