RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 KCNC2Q96PR1 638 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 COPG2Q9UBF2 871 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.85■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 A0A0G2JN53 185 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 FAM227AF5H4B4 570 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 TAPBPO15533 448 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 DNAJB6O75190 326 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 IFNA16P05015 189 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 PHEXP78562 749 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 CHIT1Q13231 466 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 TBCCQ15814 346 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 MNS1Q8NEH6 495 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 WDR34Q96EX3 536 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 MAGED4Q96JG8 741 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.84■□□□□ 0.13
CASP9-211ENST00000546969 K7EPI3 171 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 KERAO60938 352 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MYO1DO94832 1006 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SP1P08047 785 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 RNF224P0DH78 156 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 PCNAP12004 261 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 EPB42P16452 691 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MSH2P43246 934 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 TDGF1P3P51864 188 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 STX4Q12846 297 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SPINK14Q6IE38 97 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MED27Q6P2C8 311 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SHISA5Q8N114 240 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SLC34A3Q8N130 599 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 TMEM156Q8N614 296 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MDS2Q8NDY4 140 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 RELTQ969Z4 430 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ESAMQ96AP7 390 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 VMP1Q96GC9 406 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 RUBCNLQ9H714 662 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.83■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SLC25A12O75746 678 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 FAM155BO75949 473 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 GFAPP14136 432 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CASP2P42575 452 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 HLCSP50747 726 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MLF1P58340 268 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SLC7A5Q01650 507 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 GUCY2DQ02846 1103 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 BMPR2Q13873 1038 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 RUNX2Q13950 521 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MROH9Q5TGP6 573 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ISCA2Q86U28 154 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 FAM47BQ8NA70 645 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 REPS1Q96D71 796 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SCMH1Q96GD3 660 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 LYRM4Q9HD34 91 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CACNA1DQ01668 2161 aa15.82■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.81■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.81■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CCL21O00585 134 aa15.81■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 DYRK3O43781 588 aa15.81■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 ZG16O60844 167 aa15.81■□□□□ 0.12
CASP9-211ENST00000546969 CTNSO60931 367 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms