RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541959.5

ARF3-208, Transcript of ADP ribosylation factor 3, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene ARF3, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF3-208	ENST00000541959	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TRABD2A	Q86V40	505 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TSLP	Q969D9	159 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	QRFPR	Q96P65	431 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	KCNC2	Q96PR1	638 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SERINC2	Q96SA4	455 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	NTMT1	Q9BV86	223 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	NUDT9	Q9BW91	350 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	LANCL2	Q9NS86	450 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FAM227A	F5H4B4	570 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PPP6C	O00743	305 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SPAG7	O75391	227 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ERLIN1	O75477	346 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	IMPDH1	P20839	514 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PIK3CB	P42338	1070 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PRKAA2	P54646	552 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SLC18A2	Q05940	514 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	NSDHL	Q15738	373 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	COLEC12	Q5KU26	742 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TMEM205	Q6UW68	189 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FAM47B	Q8NA70	645 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CCDC126	Q96EE4	140 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	APOPT1	Q96IL0	206 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CENPH	Q9H3R5	247 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959		G3V2L1	256 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PCDH17	O14917	1159 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PRMT3	O60678	531 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	OR4F21	O95013	312 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	WISP1	O95388	367 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PDGFA	P04085	211 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CASR	P41180	1078 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RAB38	P57729	211 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RHAG	Q02094	409 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TLE1	Q04724	770 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	KLRB1	Q12918	225 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FRG2	Q64ET8	278 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RGMA	Q96B86	450 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FRG2B	Q96QU4	278 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SMC6	Q96SB8	1091 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MID2	Q9UJV3	735 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959		A0A1B0GTL3	188 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CEACAM4	O75871	244 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CYC1	P08574	325 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CPA3	P15088	417 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MAOA	P21397	527 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	HMOX2	P30519	316 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	LIM2	P55344	173 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	OR4D2	P58180	307 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	BTG2	P78543	158 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	RCN2	Q14257	317 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	MYBPC3	Q14896	1274 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	PCOLCE	Q15113	449 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	SFT2D3	Q587I9	215 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CFAP157	Q5JU67	520 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARF3-208	ENST00000541959	TEX19	Q8NA77	164 aa		18.47	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms