RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-222ENST00000531967 SYNMO15061 1565 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 GPAA1O43292 621 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 SPRY2O43597 315 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 AHSA1O95433 338 aa4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 C1QTNF9P0C862 333 aa4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 ESYT2A0FGR8 921 aa4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 NUP160Q12769 1436 aa4.94□□□□□ -1.62
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ECHDC1-222ENST00000531967 ABCA8O94911 1581 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 HSPB2A8KAH6 182 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 E9PMD0 336 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 H3BQV1 296 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 ITGB1BP1O14713 200 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-222ENST00000531967 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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