RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	HCN1	O60741	890 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HAUS5	O94927	633 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6B1	O95007	311 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC5C	O95185	931 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	AMH	P03971	560 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CELA3A	P09093	270 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SPARC	P09486	303 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CD36	P16671	472 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NR1D1	P20393	614 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MSH3	P20585	1137 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DRD5	P21918	477 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	S100P	P25815	95 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	G0S2	P27469	103 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HSD11B1	P28845	292 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CRABP1	P29762	137 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MIP	P30301	263 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB5	P36952	375 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTR1B	P42025	376 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CDKN2B	P42772	138 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	BCAP31	P51572	246 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CCR4	P51679	360 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	LBX1	P52954	281 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPK12	P53778	367 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CCL23	P55773	120 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DAOA	P59103	153 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ST8SIA6	P61647	398 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	VSNL1	P62760	191 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GUCY1A3	Q02108	690 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CA9	Q16790	459 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PHKG1	Q16816	387 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	COQ5	Q5HYK3	327 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	EMB	Q6PCB8	327 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM199	Q8N511	208 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	EMC1	Q8N766	993 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	GRHL3	Q8TE85	626 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MYLPF	Q96A32	169 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TAAR6	Q96RI8	345 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF607	Q96SK3	696 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MED10	Q9BTT4	135 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	COG4	Q9H9E3	785 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	MKLN1	Q9UL63	735 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NR2E1	Q9Y466	385 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	COL4A6	Q14031	1691 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	SCN5A	Q14524	2016 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM92A	A1XBS5	289 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	LIPT2	A6NK58	231 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	WASH3P	C4AMC7	463 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971		I3L4J1	428 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971		M0QZK8	103 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FBXO38-208	ENST00000504971	CLDN5	O00501	218 aa		6.48	□□□□□ -1.37

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