RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 OR52J3Q8NH60 311 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NFKBIDQ8NI38 313 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 HTRA1Q92743 480 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 FKBP10Q96AY3 582 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 RUBCNLQ9H714 662 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PRSS16Q9NQE7 514 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 KRT84Q9NSB2 600 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 WBP1LQ9NX94 342 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF21O75509 655 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NFATC1O95644 943 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 CD6P30203 668 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PCGF2P35227 344 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 MAPK9P45984 424 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ITGA1P56199 1179 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 UBE3AQ05086 875 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 DPTQ07507 201 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PAGE2BQ5JRK9 111 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 FAM124AQ86V42 546 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 RNF130Q86XS8 419 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SUSD6Q92537 303 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D20Q96BZ9 403 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ABCG4Q9H172 646 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NOX1Q9Y5S8 564 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 M0QX08 132 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 UGT2B11O75310 529 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 CA3P07451 260 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 GABARAPL2P60520 117 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 METTL4Q8N3J2 472 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 KLK6Q92876 244 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SMARCD2Q92925 531 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 MUL1Q969V5 352 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 DOHHQ9BU89 302 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NDEL1Q9GZM8 345 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ADPRHL2Q9NX46 363 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NDUFAF4Q9P032 175 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TAC3Q9UHF0 121 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 LATO43561 262 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 GPR37L1O60883 481 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NDUFS2O75306 463 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SOAT1P35610 550 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 RPP38P78345 283 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NPTX1Q15818 432 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 AMZ2Q86W34 360 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.441e-19■□□□□ 8.7
PRAME-213ENST00000492657 HERVK_113Q902F9 699 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 KCNC2Q96PR1 638 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 F2RL3Q96RI0 385 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SLC6A16Q9GZN6 736 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 RLIMQ9NVW2 624 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 C5AR2Q9P296 337 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 FEZF1A0PJY2 475 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 J3KTA2 159 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 JRKO75564 520 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 VIPP01282 170 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 C9P02748 559 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 OPRD1P41143 372 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PRIM2P49643 509 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 RPS26P62854 115 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SELENOWP63302 87 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 OCA2Q04671 838 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 IL18R1Q13478 541 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PDE7AQ13946 482 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 SCARB2Q14108 478 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 DGCR6Q14129 220 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 GPR153Q6NV75 609 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 FAR1Q8WVX9 515 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R16AQ96I34 528 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 TPK1Q9H3S4 243 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 DPEP2Q9H4A9 486 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 EHD1Q9H4M9 534 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 C1GALT1Q9NS00 363 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 GIN1Q9NXP7 522 aa12.29□□□□□ -0.44
PRAME-213ENST00000492657 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms