RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SEC16A	O15027	2179 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	UBXN8	O00124	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SUPT3H	O75486	399 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC3A	O75596	197 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	NEURL1	O76050	574 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	STX2	P32856	288 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CAV1	Q03135	178 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CYS1	Q717R9	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ASIC3-208	ENST00000490540	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	POLQ	O75417	2590 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	B3GALT2	O43825	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MYO1D	O94832	1006 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MSH2	P43246	934 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	RAB38	P57729	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	IRF8	Q02556	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CHIT1	Q13231	466 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ART3	Q13508	389 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ISCA2	Q86U28	154 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	TTL	Q8NG68	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	RELT	Q969Z4	430 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	HMX2	A2RU54	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	SP1	P08047	785 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MYBL2	P10244	700 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	PCNA	P12004	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CD46	P15529	392 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	GSTM2	P28161	218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	HTR1E	P28566	365 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MTTP	P55157	894 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	LIM2	P55344	173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MLF1	P58340	268 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ASIC3-208	ENST00000490540	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.19	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms