RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MAU2Q9Y6X3 613 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 H7BY64 318 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 HAT1O14929 419 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 UGDHO60701 494 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MED26O95402 600 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 CLDN9O95484 217 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 GNAZP19086 355 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 SERPINB3P29508 390 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 CCNG1P51959 295 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 CORO7P57737 925 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 FOXL2P58012 376 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 DSG2Q14126 1118 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM53BQ14153 422 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MYBPC3Q14896 1274 aa10□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 LIPJQ5W064 366 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 GRHL2Q6ISB3 625 aa10□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 VN1R5Q7Z5H4 357 aa10□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 C17orf64Q86WR6 236 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 CDYL2Q8N8U2 506 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 WDR20Q8TBZ3 569 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 STT3BQ8TCJ2 826 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MIEF2Q96C03 454 aa10□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 CRB3Q9BUF7 120 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 SARGQ9BW04 601 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 RABEP2Q9H5N1 569 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 KCNK13Q9HB14 408 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 C14orf105Q9NVL8 296 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 STK38LQ9Y2H1 464 aa10□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 TIMM22Q9Y584 194 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 FER1L5A0AVI2 2057 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 TTLL8A6PVC2 850 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 H0YIV9 168 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 SOCS6O14544 535 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 AZIN1O14977 448 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 IRF8Q02556 426 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 KLC1Q07866 573 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 HKDC1Q2TB90 917 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 NADK2Q4G0N4 442 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 XKR6Q5GH73 641 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 COLEC12Q5KU26 742 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 AGR3Q8TD06 166 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 TM9SF4Q92544 642 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MIB2Q96AX9 1013 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.99□□□□□ -0.81
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SCAMP4-208ENST00000489554 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 ACTR8Q9H981 624 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP4-208ENST00000489554 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.99□□□□□ -0.81
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