RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM20BO75063 409 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNDBP1O95273 360 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK5O95279 499 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPPBP16860 134 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK1P28482 360 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDELR2P33947 212 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNC4Q03721 635 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYAL1Q12794 435 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PJA1Q8NG27 643 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT84Q9NSB2 600 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT52Q9Y366 437 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF4O00268 1085 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCRL2O00421 344 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLPXO76031 633 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VIPP01282 170 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRATP43155 626 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNMTP50135 292 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNC2Q96PR1 638 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCG4Q9H172 646 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FZD4Q9ULV1 537 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H0Y8X5 98 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0R129 80 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MT-ND2P03891 347 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCNKAP51800 687 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP1S2P56377 157 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCS1P62166 190 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPS8Q12929 822 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAC3Q9UHF0 121 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGAT4DA6NG13 374 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0R3G1 203 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU2F1P14859 743 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAP2Q03519 686 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OXA1LQ15070 435 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYT16Q17RD7 645 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INAVAQ3KP66 663 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF385BQ569K4 471 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADCK2Q7Z695 626 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UCN3Q969E3 161 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP26Q9BV47 211 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REEP1Q9H902 201 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USE1Q9NZ43 259 aa14.85□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCC2O75069 709 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPS1L1P21108 318 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPCAL1P37235 193 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT6P53370 316 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN2P57739 230 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTOV1Q86YD1 416 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAR1Q8WVX9 515 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGED4Q96JG8 741 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRR3A8MPY1 467 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICMTO60725 284 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPLNO95428 1278 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCKP06239 509 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBL4AP11441 157 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT3P56703 355 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAB1Q13480 694 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CST6Q15828 149 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.84□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms