RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488161.1

C7orf49-212, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf49, Length 124 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-212ENST00000488161 NT5DC2Q9H857 520 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 IPPKQ9H8X2 491 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ACTR8Q9H981 624 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 C5AR2Q9P296 337 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PCTPQ9UKL6 214 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.2□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 URADA6NGE7 173 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CYR61O00622 381 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PLPP1O14494 284 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 B3GALT2O43825 422 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PRMT3O60678 531 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LDB3O75112 727 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 WDPCPO95876 746 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 GBAP04062 536 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 RNF224P0DH78 156 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PYGBP11216 843 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 JAK1P23458 1154 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CASP2P42575 452 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SSR2P43308 183 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 MTTPP55157 894 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CDH13P55290 713 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LIM2P55344 173 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SLC26A5P58743 744 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ARG2P78540 354 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PMP22Q01453 160 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF33BQ06732 778 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LAPTM5Q13571 262 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 NR6A1Q15406 480 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 C18orf63Q68DL7 685 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 BEST3Q8N1M1 668 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 UCN3Q969E3 161 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ZBTB9Q96C00 473 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 FAR2Q96K12 515 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TMEM237Q96Q45 408 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SERINC2Q96SA4 455 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 HBEGFQ99075 208 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LPAR4Q99677 370 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 HES7Q9BYE0 225 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 KCNK13Q9HB14 408 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 EMCNQ9ULC0 261 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 DAPP1Q9UN19 280 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 RELNP78509 3460 aa6.19□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 A0A1W2PS29 197 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 STX16O14662 325 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 TMPRSS11DO60235 418 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 DLX3O60479 287 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 SMIM24O75264 130 aa6.18□□□□□ -1.42
C7orf49-212ENST00000488161 WISP2O76076 250 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms