RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 ATP4BP51164 291 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 PON2Q15165 354 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CARTPTQ16568 116 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GALNT10Q86SR1 603 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FATE1Q969F0 183 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 E2F2Q14209 437 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 TGM7Q96PF1 710 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ZIC5Q96T25 663 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 BCAP31P51572 246 aa12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TRIB3Q96RU7 358 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SYT11Q9BT88 431 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ACTL8Q9H568 366 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SEC16AO15027 2179 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD33BA6NCL7 494 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 RPP14O95059 124 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SEMA4FO95754 770 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 IL4RP24394 825 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SLC15A3Q8IY34 581 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 FGF13Q92913 245 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 TACSTD2P09758 323 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 GDI2P50395 445 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 OR12D2P58182 307 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PLGLB1Q02325 96 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TCEANCQ8N8B7 351 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PQ72 361 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FABP12A6NFH5 140 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PSMD9O00233 223 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 T-ENOLP0DO92 83 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 RNH1P13489 461 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 HTR6P50406 440 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ARSFP54793 590 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 27.9
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HDLBP-241ENST00000487169 RAB43Q86YS6 212 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PTGES2Q9H7Z7 377 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GRXCR1A8MXD5 290 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 OR12D1P0DN82 309 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TRAM2Q15035 370 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 IDNKQ5T6J7 187 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 DNM1P34Q6PK57 102 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 OR5T3Q8NGG3 340 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MR1Q95460 341 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 RNF38Q9H0F5 515 aa12.84□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.84□□□□□ -0.35
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