RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 STX16O14662 325 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PRAMEF4O60810 478 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJB6O75190 326 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CLDN9O95484 217 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PIK3CBP42338 1070 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SSR2P43308 183 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CD97P48960 835 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC5A8Q8N695 610 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 RGMAQ96B86 450 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TBK1Q9UHD2 729 aa25.21■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM227AF5H4B4 570 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SH3BGRLO75368 114 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MAOAP21397 527 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HSD17B7P56937 341 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 BTG2P78543 158 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RUNX2Q13950 521 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 VN1R5Q7Z5H4 357 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF595Q8IYB9 648 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 C7orf57Q8NEG2 295 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MS4A8Q9BY19 250 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PPCSQ9HAB8 311 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MMP25Q9NPA2 562 aa25.2■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 BAHCC1Q9P281 2608 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CELA2AP08217 269 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CERS1P27544 350 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 E2F2Q14209 437 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM47BQ8NA70 645 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GALNT11Q8NCW6 608 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 OR1N1Q8NGS0 311 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.19■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TRAV17A0A0B4J275 112 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC14BA6NHZ5 514 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 E2F3O00716 465 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 EFNA3P52797 238 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 LIM2P55344 173 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 STX4Q12846 297 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MEP1AQ16819 746 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DEPDC1Q5TB30 811 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ADNP2Q6IQ32 1131 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 Q8NA96 180 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HAS2Q92819 552 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 QRFPRQ96P65 431 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 AICDAQ9GZX7 198 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 OR51B5Q9H339 312 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 LYRM4Q9HD34 91 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PLA2G3Q9NZ20 509 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DAPP1Q9UN19 280 aa25.18■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 BLACEA4D250 179 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 A8MUA0 341 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 C4orf51C9J302 202 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 H0YIV9 168 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SAP18O00422 153 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 IFNA16P05015 189 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT15P19012 456 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFRSF8P28908 595 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SOX11P35716 441 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TSFMP43897 325 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC26A5P58743 744 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 IFT88Q13099 833 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CUZD1Q86UP6 607 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SHISA5Q8N114 240 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ACOT4Q8N9L9 421 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMF1Q92530 271 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM7Q9NQW5 492 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DCDC2Q9UHG0 476 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.17■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 OTCP00480 354 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GSTA1P08263 222 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CPN2P22792 545 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms