RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 UGT2B7P16662 529 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FCARP24071 287 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PSMB5P28074 263 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CDC42P60953 191 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ID2Q02363 134 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 STX19Q8N4C7 294 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PJA1Q8NG27 643 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM74Q96NL1 305 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 COL21A1Q96P44 957 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TIPRLO75663 272 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 EFEMP2O95967 443 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINA1P01009 418 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NCK1P16333 377 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PKLRP30613 574 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GSK3BP49841 420 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA1P56199 1179 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GPLD1P80108 840 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TRAF3Q13114 568 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TUBB3Q13509 450 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OR2L3Q8NG85 312 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 VMP1Q96GC9 406 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MAP10Q9P2G4 905 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FHP07954 510 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MATN1P21941 496 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FADDQ13158 208 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IYDQ6PHW0 289 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CADM2Q8N3J6 435 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 WDR48Q8TAF3 677 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 RYKP34925 604 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CASP9P55211 416 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SHC2P98077 582 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 HYAL2Q12891 473 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SERTAD2Q14140 314 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GBX1Q14549 363 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NRF1Q16656 503 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 ARL14Q8N4G2 192 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM156Q8N614 296 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ARL10Q8N8L6 244 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FAM47BQ8NA70 645 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 NACC2Q96BF6 587 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF347Q96SE7 839 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ACPTQ9BZG2 426 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 KRT87PA6NCN2 255 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 G3V2T6 193 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 RAP2AP10114 183 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MIEF2Q96C03 454 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PEX11GQ96HA9 241 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 HYKKA2RU49 373 aa7.9□□□□□ -1.14
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