RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 RAB38P57729 211 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 NADK2Q4G0N4 442 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 UNC50Q53HI1 259 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IGFL3Q6UXB1 125 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 REPS1Q96D71 796 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PTCHD1Q96NR3 888 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 KCNC2Q96PR1 638 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 DMRT3Q9NQL9 472 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 DAPP1Q9UN19 280 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTL3 188 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SAP18O00422 153 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRMT3O60678 531 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SCELO95171 688 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CD97P48960 835 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LIM2P55344 173 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RPS13P62277 151 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 HERVK_113P63132 956 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SFT2D3Q587I9 215 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZNF678Q5SXM1 525 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IGFL2Q6UWQ7 119 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 AGAP4Q96P64 663 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-6Q9BXR3 956 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MFRPQ9BY79 579 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ROGDIQ9GZN7 287 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 EPN3Q9H201 632 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRM3Q9NNZ6 103 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PSD3Q9NYI0 1048 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TLDC2A0PJX2 215 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 GLRA3O75311 464 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ICAM2P13598 275 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN8P19075 237 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IMPDH1P20839 514 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MAOAP21397 527 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CRHR1P34998 444 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 NEK2P51955 445 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRKAA2P54646 552 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 GGTA1PQ4G0N0 100 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MILR1Q7Z6M3 343 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ACOT4Q8N9L9 421 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TMEM52Q8NDY8 209 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 OR4F6Q8NGB9 312 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TMEM237Q96Q45 408 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 NECTIN3Q9NQS3 549 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 KCMF1Q9P0J7 381 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZNF225Q9UK10 706 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RAB21Q9UL25 225 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 G3V2L1 256 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CYR61O00622 381 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ETHE1O95571 254 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ITGAMP11215 1152 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SOX11P35716 441 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CCT5P48643 541 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 OR4D2P58180 307 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PHEXP78562 749 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CLCQ05315 142 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SLC18A2Q05940 514 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 AP5B1Q2VPB7 878 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PLAG1Q6DJT9 500 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 OR4C11Q6IEV9 310 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A9Q8IVM8 553 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SCUBE1Q8IWY4 988 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MREGQ8N565 214 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TRPC4APQ8TEL6 797 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RGMAQ96B86 450 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CSF3RQ99062 836 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LYRM4Q9HD34 91 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MMACHCQ9Y4U1 282 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CLDN16Q9Y5I7 305 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SCN2AQ99250 2005 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PLPP1O14494 284 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SUPT7LO94864 414 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 OTCP00480 354 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PROCP04070 461 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 KRT4P19013 534 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SSR2P43308 183 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ARFIP1P53367 373 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TLE1Q04724 770 aa19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms