RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ETV7	Q9Y603	341 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CACNA1F	O60840	1977 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A087X0K7	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ANHX	E9PGG2	379 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF103	O00237	685 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	INPP4B	O15327	924 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ANGPTL1	O95841	491 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SBK2	P0C263	348 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ACKR3	P25106	362 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	GJB2	P29033	226 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ATP5D	P30049	168 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SERPINB6	P35237	376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	BACE1	P56817	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ARHGAP1	Q07960	439 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR50	Q13585	617 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	RCN2	Q14257	317 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	C3AR1	Q16581	482 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	AGAP6	Q5VW22	663 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	NUP93	Q8N1F7	819 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR148	Q8TDV2	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM222B	Q8WU58	562 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	PANX3	Q96QZ0	392 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	PANK3	Q9H999	370 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	S100A14	Q9HCY8	104 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM170A	A1A519	330 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	MAGEB16	A2A368	324 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM149A	A5PLN7	773 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SERINC4	A6NH21	518 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447		M0R296	226 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF263	O14978	683 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CHUK	O15111	745 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	LYN	P07948	512 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SKIL	P12757	684 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ACADS	P16219	412 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CAPN2	P17655	700 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FCGR2C	P31995	323 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TAF6	P49848	677 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	PEX3	P56589	373 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	KRT83	P78385	493 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CD300C	Q08708	224 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF146	Q15072	292 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	KCTD9	Q7L273	389 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	MCM10	Q7L590	875 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	IQCA1	Q86XH1	822 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF130	Q86XS8	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	LIPH	Q8WWY8	451 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	WBP1	Q96G27	269 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SOST	Q9BQB4	213 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	FUT8	Q9BYC5	575 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TRIM7	Q9C029	511 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	MED17	Q9NVC6	651 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TARDBP-208	ENST00000477447	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TARDBP-208	ENST00000477447	P2RX6	O15547	441 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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