RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475359.5

GIGYF2-233, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 825 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-233	ENST00000475359	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	RIN1	Q13671	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SQLE	Q14534	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SHB	Q15464	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MAPK11	Q15759	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZNF77	Q15935	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359		Q4G0T1	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	4e-6	■□□□□ 11.2
GIGYF2-233	ENST00000475359	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	RIT1	Q92963	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	PEX13	Q92968	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ACOX2	Q99424	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CCT7	Q99832	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	F5	P12259	2224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359		E7ENX8	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359		K7ENP7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	LAD1	O00515	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EBAG9	O00559	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SPRY2	O43597	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EDIL3	O43854	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	HSF2BP	O75031	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CREG1	O75629	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CTAG2	O75638	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EDN1	P05305	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	G6PD	P11413	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CDK4	P11802	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CCDC130	P13994	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	MAK	P20794	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	GCSH	P23434	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ADRA1D	P25100	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	PKLR	P30613	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	GPR143	P51810	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	C21orf59	P57076	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ACTR3	P61158	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	SIRPA	P78324	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	KLC3	Q6P597	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIGYF2-233	ENST00000475359	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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