RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 M0QYV0 167 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 M0QZ92 97 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 RECQL4O94761 1208 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 RLN2P04090 185 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ALPPP05187 535 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TPOP07202 933 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 APRTP07741 180 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FHP07954 510 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CD3GP09693 182 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SPNP16150 400 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FAHP16930 419 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CYP2B6P20813 491 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CA4P22748 312 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 PROZP22891 400 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FPR3P25089 353 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CFPP27918 469 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ACADLP28330 430 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 MAPK4P31152 587 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 HOXC9P31274 260 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 THBS2P35442 1172 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CSNK1DP48730 415 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 RGS6P49758 472 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 PRRX1P54821 245 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ADPRHP54922 357 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TAS2R40P59535 323 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 NR0B2Q15466 257 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 HFEQ30201 348 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 COLEC12Q5KU26 742 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 BICRALQ6AI39 1079 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 C16orf89Q6UX73 402 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 IQCHQ86VS3 1027 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM17Q86X19 198 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 DHFR2Q86XF0 187 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 GPR65Q8IYL9 337 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SFRP1Q8N474 314 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 METTL13Q8N6R0 699 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 Q8NFD4 153 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 NDNFQ8TB73 568 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TOP1MTQ969P6 601 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC35A4Q96G79 324 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNC2Q96PR1 638 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 OR1F2PQ96R84 312 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TRABDQ9H4I3 376 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 MED17Q9NVC6 651 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF639Q9UID6 485 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 HSPB11Q9Y547 144 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PPC1 479 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PPL8 197 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PPQ1 181 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM234BA2RU67 622 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 XKRY2A2RUG3 117 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 MYMKA6NI61 221 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 AGAP5A6NIR3 686 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC28A1O00337 649 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 UBE2CO00762 179 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 COPEO14579 308 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC16A6O15403 523 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 NOBOXO60393 691 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 AHSA1O95433 338 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 MPIG6BO95866 241 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CSTAP01040 98 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 AHSGP02765 367 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 RAF1P04049 648 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 SERPING1P05155 500 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.74□□□□□ -1.49
ECHDC1-215ENST00000475319 STAG3L3P0CL85 134 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms