RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PDE7BQ9NP56 450 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PEX12O00623 359 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC16A1P53985 500 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 E2F1Q01094 437 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PARGQ86W56 976 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SYT12Q8IV01 421 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CHST14Q8NCH0 376 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ART5Q96L15 291 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RHBGQ9H310 441 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IPPKQ9H8X2 491 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NUP50Q9UKX7 468 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MAGEB3O15480 346 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NDUFB5O43674 189 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC22A3O75751 556 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PAPLNO95428 1278 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IGHEP01854 428 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 LINC00032P0C843 101 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TIMP2P16035 220 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRKACBP22694 351 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IGFBP5P24593 272 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CD27P26842 260 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SSR2P43308 183 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MAGEA2P43356 314 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CCR8P51685 355 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CLCNKAP51800 687 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PTSQ03393 145 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NAE1Q13564 534 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PGS1Q32NB8 556 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZNF773Q6PK81 442 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CDC6Q99741 560 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NDC1Q9BTX1 674 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CD93Q9NPY3 652 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GLS2Q9UI32 602 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MED16Q9Y2X0 877 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.37□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FAM234BA2RU67 622 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FUOMA2VDF0 154 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CLDN9O95484 217 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ALDH4A1P30038 563 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RORAP35398 523 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 KCNC1P48547 511 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EMX2Q04743 252 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 HTR4Q13639 388 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MED22Q15528 200 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PHF19Q5T6S3 580 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM198Q66K66 360 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GK5Q6ZS86 529 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SYVN1Q86TM6 617 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CRELD1Q96HD1 420 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ACSS2Q9NR19 701 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 KLHL1Q9NR64 748 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IGLON5A6NGN9 336 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 AP1G1O43747 822 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CISD3P0C7P0 127 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TSPAN8P19075 237 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms