RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 M1APQ8TC57 530 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MTBPQ96DY7 904 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PHF21BQ96EK2 531 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 KCNC2Q96PR1 638 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 IPPKQ9H8X2 491 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 KCNK13Q9HB14 408 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SH3BGRLO75368 114 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TGFB1P01137 390 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF33BQ06732 778 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 LIPJQ5W064 366 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 CHSY3Q70JA7 882 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 HAS2Q92819 552 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MMP25Q9NPA2 562 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 STMN3Q9NZ72 180 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.5■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 E2F3O00716 465 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 F10P00742 488 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A5P58743 744 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 RCN2Q14257 317 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 FAM47BQ8NA70 645 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.49■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN4O14493 209 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 STX16O14662 325 aa22.48■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 REPS1Q96D71 796 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.48■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 OR51B5Q9H339 312 aa22.48■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 DAPP1Q9UN19 280 aa22.48■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 A8MUA0 341 aa22.47■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 TNFSF10P50591 281 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 HSD17B7P56937 341 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SLC13A2Q13183 592 aa22.47■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.47■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 RNF32Q9H0A6 362 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 FETUBQ9UGM5 382 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.47■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 LRRK2Q5S007 2527 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 H0YIV9 168 aa22.46■■□□□ 1.19
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