RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 MS4A8Q9BY19 250 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF358Q9NW07 568 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 CENPEQ02224 2701 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CERS1P27544 350 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 FHL5Q5TD97 284 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MED27Q6P2C8 311 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4X1Q8N118 509 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2E3Q969T4 207 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SERINC2Q96SA4 455 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 15.8
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 OR5H15A6NDH6 313 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MTTPP55157 894 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RAB38P57729 211 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 IFT20Q8IY31 132 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 BEST3Q8N1M1 668 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 OR7G3Q8NG95 312 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ELP5Q8TE02 316 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 FAR1Q8WVX9 515 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MAN1A2O60476 641 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA7AO75326 666 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 KRT38O76015 456 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PCNAP12004 261 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LIM2P55344 173 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 FAM47BQ8NA70 645 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 KCNC2Q96PR1 638 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 DAPP1Q9UN19 280 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CYR61O00622 381 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 E2F3O00716 465 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CNTFP26441 200 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TGM3Q08188 693 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PRR7Q8TB68 274 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TAAR6Q96RI8 345 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CSF3RQ99062 836 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 AGFG2O95081 481 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD2P08910 425 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINB1P30740 379 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 HSD17B7P56937 341 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 GTF2H2Q13888 395 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MEP1AQ16819 746 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SLC5A8Q8N695 610 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 A8MUA0 341 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SH3BGRLO75368 114 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TGFB1P01137 390 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TAS2R50P59544 299 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 INAQ16352 499 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RNF175Q8N4F7 328 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 BCORP1Q8N888 145 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SLX1AQ9BQ83 275 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ACTR8Q9H981 624 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 XPR1Q9UBH6 696 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms