RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 SARAFQ96BY9 339 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PYCR2Q96C36 320 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FAM173AQ9BQD7 235 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 LDAHQ9H6V9 325 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 EXO5Q9H790 373 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PARVBQ9HBI1 364 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 MMACHCQ9Y4U1 282 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 AVILO75366 819 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ATP6AP2O75787 350 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ATE1O95260 518 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CELA3AP09093 270 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PPP2R1BP30154 601 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SLC1A2P43004 574 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SP140Q13342 867 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 C4orf22Q6V702 233 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 GSTA5Q7RTV2 222 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CA13Q8N1Q1 262 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM5Q9C035 493 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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PTPRA-208ENST00000455631 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 URADA6NGE7 173 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 WWP2O00308 870 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TPSB2P20231 275 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SCTRP47872 440 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TPSAB1Q15661 275 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PHKG1Q16816 387 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SNF8Q96H20 258 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 RASL10BQ96S79 203 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 MYOTQ9UBF9 498 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SYT5O00445 386 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SUSD5O60279 629 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HIST1H2ADP20671 130 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CNR1P21554 472 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TACR1P25103 407 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 GPR143P51810 404 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CDK16Q00536 496 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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PTPRA-208ENST00000455631 RTL4Q6ZR62 310 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 LRRC46Q96FV0 321 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 OR4K3Q96R72 315 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 MDFIQ99750 246 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TSPY26PQ9H489 355 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HEXAP06865 529 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 GABRA1P14867 456 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 AHRP35869 848 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DNASE1L1P49184 302 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 RGS4P49798 205 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SLC10A1Q14973 349 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NUDT8Q8WV74 236 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ARSGQ96EG1 525 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SCYL1Q96KG9 808 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SH3GL2Q99962 352 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRA-208ENST00000455631 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HSPB2A8KAH6 182 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 C4orf51C9J302 202 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 BMP5P22003 454 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HOXC12P31275 282 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ASCL1P50553 236 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SLC13A2Q13183 592 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CSHL1Q14406 222 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HSPB2Q16082 182 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CCNG2Q16589 344 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DUPD1Q68J44 220 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CHSY3Q70JA7 882 aa21.5■■□□□ 1.03
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