RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC151A5D8V7 595 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 A6NL46 340 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BQF6 201 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP6CO00743 305 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ERLIN1O75477 346 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QL1O75973 258 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PGDP52209 483 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB38P57729 211 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT88Q13099 833 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NSDHLQ15738 373 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 APOPT1Q96IL0 206 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINI1Q99574 410 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OXSMQ9NWU1 459 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF225Q9UK10 706 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX6Q9UNH7 406 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MED13Q9UHV7 2174 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GTL3 188 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2W5A6NFC9 320 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CYR61O00622 381 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN4O14493 209 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PRMT3O60678 531 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 B4GALT2O60909 372 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA3DO95025 777 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PRB1P04280 392 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPAN8P19075 237 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NEK2P51955 445 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LIM2P55344 173 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PKNOX1P55347 436 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 AP2B1P63010 937 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF33BQ06732 778 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LCP2Q13094 533 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PCOLCEQ15113 449 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT71Q3SY84 523 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF175Q8N4F7 328 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC63Q8NA47 563 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SMC6Q96SB8 1091 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT9Q9BW91 350 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LHPPQ9H008 270 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ATMQ13315 3056 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 BLACEA4D250 179 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 B8ZZF3 427 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM227AF5H4B4 570 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EM74 188 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MASP2O00187 686 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4F21O95013 312 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ALPPP05187 535 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINA7P05543 415 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGA3P26006 1051 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CERS1P27544 350 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RAP1GDS1P52306 607 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NAGLUP54802 743 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B7P56937 341 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 Q0VFX4 171 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NFATC3Q12968 1075 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LIPMQ5VYY2 423 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms