RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 COMMD7Q86VX2 200 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MICALL2Q8IY33 904 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 LGI4Q8N135 537 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 OR2M2Q96R28 347 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 C2orf81A6NN90 581 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KPNA5O15131 536 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 DIRAS1O95057 198 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CLDN9O95484 217 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CALCRP30988 508 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 NUDT6P53370 316 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CMIPQ8IY22 773 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CCDC120Q96HB5 630 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KCTD7Q96MP8 289 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PIP5K1AQ99755 562 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 BEX2Q9BXY8 128 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ACER3Q9NUN7 267 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PRSS56P0CW18 603 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 HSMCR30P0CW71 290 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CBSLP0DN79 551 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ITPKAP23677 461 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 AKAP5P24588 427 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CBSP35520 551 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 GAS1P54826 345 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PTPRCAPQ14761 206 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 UGT8Q16880 541 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 SPIN4Q56A73 249 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PYDC2Q56P42 97 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TRIQKQ629K1 86 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ELMO1Q92556 727 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CHFRQ96EP1 664 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 SPATA17Q96L03 361 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 SLC6A18Q96N87 628 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 JAM3Q9BX67 310 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 RLIMQ9NVW2 624 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MPP6Q9NZW5 540 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 H3BM21 787 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PI15O43692 258 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PRKYO43930 277 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 UGDHO60701 494 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TNFRSF21O75509 655 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CDRT1O95170 752 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PRLP01236 227 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 GABRA5P31644 462 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CD96P40200 585 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 MAN2A2P49641 1150 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 HMGCS1Q01581 520 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 HSF2Q03933 536 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 CACNG1Q06432 222 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 IL31Q6EBC2 164 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 ARSKQ6UWY0 536 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-208ENST00000441439 Q8N402 240 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms