RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 LILRA5A6NI73 299 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HACD1B0YJ81 288 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ENP7 123 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHUKO15111 745 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KMOO15229 486 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZW10O43264 779 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD1O60671 282 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA9O76027 345 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK17BO94768 372 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTL6BO94805 426 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPSP0C0P6 89 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A4P14672 509 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMD1P17707 334 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VCLP18206 1134 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGB6P18564 788 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSH3P20585 1137 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FPR3P25089 353 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGCLP35914 325 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CETN2P41208 172 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMAN1P49257 510 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS41P49754 854 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP2B1P63010 937 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF5AQ12840 1032 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF10Q13118 480 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX6Q13608 980 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGA9Q13797 1035 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSHL1Q14406 222 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPSAP1Q14558 356 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIR2DS5Q14953 304 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IYDQ6PHW0 289 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMZ2Q86W34 360 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTP4Q96DX8 246 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGF29Q96ES7 293 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS50Q96JG6 964 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 C12orf66Q96MD2 445 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPM1MQ96MI6 270 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS35Q96QK1 796 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCRL5Q96RD9 977 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VAT1Q99536 393 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB8Q9H765 288 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RMI1Q9H9A7 625 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17CQ9P0M4 197 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMFRQ9UKV5 643 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSAPA4D1B5 854 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGSL1A5PLK6 1076 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT87PA6NCN2 255 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf81A6NN90 581 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 E7EVH7 732 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 QSOX1O00391 747 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUV39H1O43463 412 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC28A2O43868 658 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 VEGFDO43915 354 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0754O94854 1291 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL18O95568 372 aa4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms