RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445		A0A1W2PPB8	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445		A0A1W2PRS3	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	OR14I1	A6ND48	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	BCKDK	O14874	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	OR2J2	O76002	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ZFAND5	O76080	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	GLI4	P10075	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	PPP2R1B	P30154	601 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	REEP5	Q00765	189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	XKR6	Q5GH73	641 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	RTL6	Q6ICC9	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36	4e-10	■■■□□ 18.3
RAB17-208	ENST00000430445	TRPV3	Q8NET8	790 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445		Q9UFV3	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445		G3V3Y1	287 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	OR6B1	O95007	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	IGHG3	P01860	377 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	KRT14	P02533	472 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	DRD2	P14416	443 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ADH7	P40394	386 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	CDKN2D	P55273	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	AP1S2	P56377	157 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ARSK	Q6UWY0	536 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	MCU	Q8NE86	351 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	ASB15	Q8WXK1	588 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	FBXL8	Q96CD0	374 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB17-208	ENST00000430445		A0A1B0GVC2	190 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	PROM1	O43490	865 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	GUCA1C	O95843	209 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	SERPINA6	P08185	405 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	GABRB3	P28472	473 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	SOX3	P41225	446 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	MAGEA3	P43357	314 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	MAGEA5	P43359	124 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	HSD17B7	P56937	341 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	TRIL	Q7L0X0	811 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	ATL1	Q8WXF7	558 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	RASL10B	Q96S79	203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	PELI2	Q9HAT8	420 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	MYOT	Q9UBF9	498 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445		A0A0G2JN53	185 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	WWP2	O00308	870 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	AQP7	O14520	342 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	WDR1	O75083	606 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	FOSL1	P15407	271 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	CNR1	P21554	472 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RAB17-208	ENST00000430445	DNASE1	P24855	282 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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