RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A25Q6KCM7 469 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 XKRXQ6PP77 449 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD12Q8N8I0 201 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OR51I1Q9H343 314 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 DISC1C4P0D8 188 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 GBAP04062 536 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CFHP08603 1231 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR89BP0CG08 455 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNQ1P51787 676 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ODF4Q2M2E3 257 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ARSKQ6UWY0 536 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA7Q96RP8 456 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 HS3ST4Q9Y661 456 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCA1A8K7I4 914 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 NRP1O14786 923 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB5O75953 348 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TMBIM6P55061 237 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OGDHQ02218 1023 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.715e-7■■□□□ 14.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RHEBQ15382 184 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM156Q8N614 296 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB8BQ92930 207 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 NANOGQ9H9S0 305 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD3Q9Y597 815 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YAE9 185 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 MEN1O00255 615 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF10BO14763 440 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf47O95873 294 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 MATN1P21941 496 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNDC8Q6A555 127 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 GRHL2Q6ISB3 625 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATC1Q76KD6 591 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A11Q8WWX8 675 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ISOC1Q96CN7 298 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SUSD3Q96L08 255 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 PSAT1Q9Y617 370 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35F4A4IF30 521 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 AURKAO14965 403 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 BCKDHAP12694 445 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 VIPR1P32241 457 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL3P36405 182 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX2P48431 317 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 HYAL2Q12891 473 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RPA4Q13156 261 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 NPY6RQ99463 290 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10A4Q9H209 315 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXL3Q9UKT7 428 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT52Q9Y366 437 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 ARVCFO00192 962 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 B4GALT2O60909 372 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RFPL1O75677 317 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 RBBP9O75884 186 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 SNTA1Q13424 505 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B12Q53GQ0 312 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRC6AQ5T6X5 926 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms