RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ARRDC3Q96B67 414 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AP2M1Q96CW1 435 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WDR92Q96MX6 357 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GABRG3Q99928 467 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPR174Q9BXC1 333 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPR87Q9BY21 358 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CD274Q9NZQ7 290 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ARMCX1Q9P291 453 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CKAP5Q14008 2032 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KLHL33A6NCF5 533 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 IQCF5A8MTL0 148 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MEI4A8MW99 385 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TMEM233B4DJY2 109 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NEMP1O14524 444 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GYG2O15488 501 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN6O43657 245 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MGRN1O60291 552 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA12O60330 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NDUFS2O75306 463 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KATNA1O75449 491 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CRCPO75575 148 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CDK14O94921 469 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SOD1P00441 154 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OTCP00480 354 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ANXA5P08758 320 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPR89BP0CG08 455 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UROSP10746 265 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HOXB2P14652 356 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GM2AP17900 193 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGT1A6P19224 532 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CYP2A7P20853 494 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C5AR1P21730 350 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGT1A1P22309 533 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGT1A4P22310 534 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EPHA3P29320 983 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CA5AP35218 305 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PTGS2P35354 604 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGT1A3P35503 534 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGT1A5P35504 534 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HK3P52790 923 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 STX1BP61266 288 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BTKQ06187 659 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GTF2H3Q13889 308 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 STARD3Q14849 445 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MYBPC3Q14896 1274 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NAA25Q14CX7 972 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CST6Q15828 149 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 XKR7Q5GH72 579 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZVL8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF366Q8N895 744 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZG16BQ96DA0 208 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OR52B2Q96RD2 323 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ABCG8Q9H221 673 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MTG2Q9H4K7 406 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms