RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 OR52E6Q96RD3 313 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C1orf21Q9H246 121 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ACTL8Q9H568 366 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 HYKKA2RU49 373 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C9JVG2 144 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 RFPL3O75679 317 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NPPAP01160 153 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CAPN3P20807 821 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 AVPR1BP47901 424 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NFYCQ13952 458 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 GPR19Q15760 415 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ITCHQ96J02 903 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 EGLN2Q96KS0 407 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TEX37Q96LM6 180 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NDC1Q9BTX1 674 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DUSP26Q9BV47 211 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PDP2Q9P2J9 529 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 USP34Q70CQ2 3546 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C1orf226A1L170 272 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CFAP73A6NFT4 308 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TMPRSS11DO60235 418 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 KLHL18O94889 574 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 KCNH1O95259 989 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NR2F6P10588 404 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CDK4P11802 303 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 IL1RNP18510 177 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DDCP20711 480 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 IL12AP29459 219 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 GABRA4P48169 554 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ARSFP54793 590 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 KCNAB1Q14722 419 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CCDC157Q569K6 752 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 VPS33AQ96AX1 596 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NPAS2Q99743 824 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 STRADBQ9C0K7 418 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 AICDAQ9GZX7 198 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 LYRM4Q9HD34 91 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 LHX9Q9NQ69 397 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FGF21Q9NSA1 209 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 STARD5Q9NSY2 213 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 EHD3Q9NZN3 535 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PSME2Q9UL46 239 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FITM1A5D6W6 292 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ANP32DO95626 131 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FURINP09958 794 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CPN2P22792 545 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NTSP30990 170 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DGKQP52824 942 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TNFRSF17Q02223 184 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FOXM1Q08050 763 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms