RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 P4HA1P13674 534 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MMP9P14780 707 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCNCP24863 283 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SIRPAP78324 504 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMF1P82094 1093 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC10A1Q14973 349 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C14orf28Q4W4Y0 310 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PAGE2BQ5JRK9 111 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSPO2Q5TGU0 170 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TEX11Q8IYF3 940 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CADM2Q8N3J6 435 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ROBO4Q8WZ75 1007 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NXPE2Q96DL1 559 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LURAP1Q96LR2 239 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SFXN2Q96NB2 322 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPIN2AQ99865 258 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KCNK15Q9H427 330 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF702PQ9H963 129 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPG21Q9NZD8 308 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IL36AQ9UHA7 158 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PADI2Q9Y2J8 665 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BRWD3Q6RI45 1802 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LTBP1Q14766 1721 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC15A5A6NIM6 579 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 USP27XA6NNY8 438 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GFYI3L273 518 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPAG7O75391 227 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGHV3-23P01764 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGHV2-70P01814 119 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HOXB7P09629 217 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC166P0CW27 439 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HSD17B1P14061 328 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ADRA2CP18825 462 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MPZP25189 248 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ACSL1P33121 698 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BSGP35613 385 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FEN1P39748 380 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GRK6P43250 576 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HTR3AP46098 478 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RPS9P46781 194 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GPM6AP51674 278 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MAPK12P53778 367 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KRTAP12-1P59990 96 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 VAMP2P63027 116 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 VEZF1Q14119 521 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MED22Q15528 200 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LINC00483Q53H64 154 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM110Q86TL2 294 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR6X1Q8NH79 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCT6BQ92526 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HVCN1Q96D96 273 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPDL1Q96EA4 605 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC35E1Q96K37 410 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GUCD1Q96NT3 240 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 STACQ99469 402 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NRTNQ99748 197 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ULBP2Q9BZM5 246 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPATC1LQ9H0A9 340 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UBN1Q9NPG3 1134 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TIGARQ9NQ88 270 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 STK26Q9P289 416 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DGKBQ9Y6T7 804 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms