RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 SLC9A5Q14940 896 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CPTPQ5TA50 214 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PDSS2Q86YH6 399 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SHISA5Q8N114 240 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TSPEARQ8WU66 669 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PPCDCQ96CD2 204 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 THTPAQ9BU02 230 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CACNA1HO95180 2353 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GLOD5A6NK44 160 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GSC2O15499 205 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SQSTM1Q13501 440 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CSRP2Q16527 193 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MUM1Q2TAK8 710 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PHF19Q5T6S3 580 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C16orf89Q6UX73 402 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CARFQ8N187 725 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SMIM10Q96HG1 83 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 INPP5KQ9BT40 448 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DUSP26Q9BV47 211 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.86■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SGK494L7N484 410 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GDF9O60383 454 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PDE5AO76074 875 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PGM1P36871 562 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C21orf58P58505 322 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PSME3P61289 254 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GPR180Q86V85 440 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CLECL1Q8IZS7 167 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 D2HGDHQ8N465 521 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 STARD8Q92502 1023 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C10orf90Q96M02 699 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C1orf21Q9H246 121 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ASB4Q9Y574 426 aa16.85■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PR48 441 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DYTNA2CJ06 578 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 D6RAR5 112 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 FXYD1O00168 92 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 B3GALT2O43825 422 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 RDH16O75452 317 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 OR2B3O76000 313 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 AIFM1O95831 613 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 WNT3P56703 355 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PDE7AQ13946 482 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 RUNX2Q13950 521 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GTDC1Q4AE62 458 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 C18orf63Q68DL7 685 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 OR1L3Q8NH93 324 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MIEF2Q96C03 454 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SERINC2Q96SA4 455 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CROTQ9UKG9 612 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS20P59510 1910 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 HYKKA2RU49 373 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SCELO95171 688 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GSNP06396 782 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DDCP20711 480 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ACP1P24666 158 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms